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代谢组学数据分析及多元统计分析与应用

时间:2020-08-05 17:56 阅读:1274 来源:互联网

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代谢组学是通过比较对照组和实验组,以寻找代谢谱差异的研究方法,近年来,代谢组学在疾病诊断,病理研究,新药开发,药物毒理学,动植物、微生物,营养学等医学与人类健康和疾病密切相关的领域有着广泛的应用,且越来越多的生命科学研究工作者选择代谢组学平台进行科学研究。

因此,我们特邀请了几位一线专家,从代谢组实验演练,从前处理-->上机检测-->生物信息分析的培训流程,通过理论和实践的结合,与大家交流和指导,希望能给大家带来新的知识和技术,在短时间内能够自主开展代谢组项目。


【内容安排】

第一天,代谢组学下机数据分析及相关软件的使用

主讲人:纪剑(江南大学),组学派创始人之一

纪剑,现任江南大学硕士生导师,江南大学食品学院食品安全与质量控制研究所副研究员。江南大学工学博士,美国NIH西海岸代谢组学研究中心联合培养博士,江南大学青年至善学者,主要从事食品安全与代谢组学,真菌毒素生物降解,细菌耐药与代谢等方面的研究。近年来主要成果发表在Biosensors & Bioelectronics,Analytical Chemistry等国际期刊,至今,发表SCI论文30余篇,论文总引用数量达到500余次,其中入选ESI高被引论文2篇。


基于MS DIAL软件的质谱数据分析及物质鉴定

1- 从原始质谱数据到代谢物数据矩阵步骤与方法简介

2- MS DIAL软件处理GCMS下机数据(数据实战演练)

- MS DIAL界面介绍及功能使用介绍

- 使用脂肪酸甲酯FAMEs计算保留指数RI

- GCMS数据库介绍及物质鉴定的关键技巧

- 解卷积、峰对齐、零填充的介绍及使用技巧

3- MS DIAL软件处理LCMS下机数据(数据实战演练)

- LCMS下机原始质谱数据转换和数据分析

- 通过质谱数据库(MoNA、NIST)鉴定LCMS检测的代谢物

- 通过in-silico fragmentation工具鉴定未知结构代谢物


第二天,多元统计分析及机器学习在代谢组学中的应用培训 

主讲人:施琳(陕西师范大学),组学派创始人之一

围绕精准医学和精准营养研究热点,开展以代谢组学、蛋白组学、转录组学、16S rDNA扩增子测序以及多组学融合技术为基础的人群队列和动物实验研究,探索膳食营养和肠道菌群相互作用对慢性疾病发生发展风险的影响和生物学机制。


1. 多元变量统计分析方法介绍

2. 使用PCA,PLS和随机森林等模型挖掘复杂数据中的价值信息

3. 生物标记物的发现和应用 

4. 多组学整体方案设计与整合模型分析

5. Metaboanalyst在线工具的介绍和使用

6. 组学神器R语言包mixOmics介绍和使用 


[课程示例]

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【参加对象

全国高校和科研院所具有相关领域背景的教师、研究人员和在读研究生。
有科研需求的临床医生。
希望通过大数据分析,提炼并研究科学问题的科研人员,尤其是研究中涉及到组学、临床数据等多变量信息的研究者。


此次课程为线上直播教学模式(ZOOM网络会议平台授课),将在开班前统一安装培训需要的软件及电子版课件资料。由于课程需要上机操作,学员请提前准备好电脑。参加的学员课后可通过微信群继续同授课老师交流,长期获得指导机会。

【注册费用】2800元/人,三人或以上报名优惠200元/人。提供纸质版盖章邀请函和正式发票。


代谢组学数据分析及多元统计分析与应用培训班(线上课程) 
时间:2020年9月12日-9月13日 
授课方式:直播

报名咨询:张依寒 13681810839   (微信同号)

点击即可在线报名参加!


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